CDS是编码序列（Coding sequence）的缩写。DNA转录成mRNA，mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质，所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列，且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列，不考虑mRNA加工等过程中的序列变化，总之，就是与蛋白质的密码子完全对应。CDS是编码一段蛋白产物的序列，是结构基因组学术语。开放阅读框ORF是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止密码子打断。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。